近親繁殖是指某個個體與其共同祖先有著直接或間接的關系。這種關系可以通過血統圖來表示，即某個個體的父母或祖父母以及其他親屬都屬于該個體的共同祖先。近親繁殖的程度可以用“近親繁殖系數”來計算，該系數最早由美國遺傳學家Sewall Wright在20世紀提出，并以符號“F”表示。
具體而言，假設個體A的父親B和母親C都屬于共同祖先D的直系血親關系。當D與B、C共有某一個特定基因位點時，該基因位點將從D傳遞給B，在接下來50%的概率下被傳遞給A。同時，在D與C共有某一個特定基因位點時，該基因位點將從D傳遞給C，在接下來50%的概率下被傳遞給A；因此，在一個特定基因位點上，個體A具有兩個拷貝的概率為12.5%。
值得注意的是，雖然D現在是C的祖父而非父親，但近親繁殖概率仍然會降低為6.25%，這是因為同一基因位點在C身上被傳遞的概率較原來的一半。
盡管以上例子比較簡單，但在一個封閉的狗群中情況往往會更加復雜。這是因為同一個體可能出現在血統圖的兩端，并且你往往會有多重的共同祖先。然而，計算近親繁殖系數所依賴的法則仍然是相同的——每個近親繁殖可能來源對于整體值具有累計效果。
具體而言，假設個體A的父親B和母親C都屬于共同祖先D的直系血親關系。當D與B、C共有某一個特定基因位點時，該基因位點將從D傳遞給B，在接下來50%的概率下被傳遞給A。同時，在D與C共有某一個特定基因位點時，該基因位點將從D傳遞給C，在接下來50%的概率下被傳遞給A；因此，在一個特定基因位點上，個體A具有兩個拷貝的概率為12.5%。
值得注意的是，雖然D現在是C的祖父而非父親，但近親繁殖概率仍然會降低為6.25%，這是因為同一基因位點在C身上被傳遞的概率較原來的一半。
盡管以上例子比較簡單，但在一個封閉的狗群中情況往往會更加復雜。這是因為同一個體可能出現在血統圖的兩端，并且你往往會有多重的共同祖先。然而，計算近親繁殖系數所依賴的法則仍然是相同的——每個近親繁殖可能來源對于整體值具有累計效果。